長期從事飲用水安全保障工作。為飲用水安全保障理論與技術發(fā)展做出突出貢獻。 1993年獲國際“居里夫人”一等博士后科學基金，1998年獲國家杰出青年科學基金，第二批“國家級高層次人才”特聘教授，首批入選國家“國家級高層次人才”一、二層次人才和跨世紀優(yōu)秀人才計劃；首批全國優(yōu)秀博士后；國家級有突出貢獻的中青年專家,享受國務院特殊津貼。獲得國家技術發(fā)明二等獎2項（均排名第一）、國家科技進步三等獎（第二完成人）、獲黑龍江省自然科學一等獎、技術發(fā)明一等獎共3項（第一完成人）、“國家級高層次人才”成就獎（2007年工程科學獎單一獲獎人）、2006年中國青年科學家獎（全國十人獲獎，工程界兩名獲獎人之一）、中國青年科技獎、2015年獲黑龍江省自然科學一等獎（第一完成人）、英國皇家化學會“Sustainable Water Award”（可持續(xù)發(fā)展水獎，2016年全球單一獲獎人，首位獲此獎項的中國學者）、美國化學會(ACS)在2017年將“水和廢水處理氧化、納米顆粒和膜技術會議”的副標題列為 “In honor of Professor Jun Ma",表彰他取得的學術成就與貢獻。2018年“過硫酸鹽高級氧化水質凈化理論與方法”獲教育部自然科學二等獎（排名第一）、2019年“基于新生態(tài)微界面特性的強化水處理技術”獲黑龍江省科學技術一等獎（排名第一）2020年獲全國先進工作者、工信部抗疫先進個人榮譽稱號。先后承擔國家科技部863項目、973子項目、國家十一五水專項子課題 以及一批省部級重點項目和多項國際合作項目。

主持國家課題20余項，培養(yǎng)百余名碩士生、博士生。其中2名獲全國百篇優(yōu)秀博士論文獎、2名獲全國百篇優(yōu)秀論文提名獎。指導的學生中有1人獲Morgan Early Career Award (2020年全球唯一獲獎人)，1人獲美國國家環(huán)保署（EPA）Early Career Award（全美三位獲獎者之一），3人獲國家級 青年人才。授權發(fā)明專利170余項，獲美國專利6項。發(fā)表SCI論文300余篇,在IF6.0以上期刊發(fā)表論文200余篇，Nature Index期刊論文153篇，論文引用頻次43864次，H因子120。