譜尼生物醫(yī)藥與中國科學院上海藥物所有著廣泛的合作，近日，譜尼生物醫(yī)藥聯合中國科學院上海藥物研究所共同推出D3CARP靶標預測及虛擬篩選項目。藥物篩選中人工智能技術的引入，可極大提高整個藥物研發(fā)流程的運行效率，協助藥企開發(fā)更高質量的藥物，進一步增強藥企的產業(yè)競爭優(yōu)勢。靶標預測：
針對某個小分子化合物，采用分子對接方法、配體相似性搜索方法和深度學習模型共三種方法進行靶標預測，其中分子對接方法包含9352個對接模型、配體相似性搜索包含3836個靶標、深度學習模型包含5901個靶標。根據要求，可分別報告前100個最可能的預測靶標或排名前1%的最可能預測靶標，并提供分子對接獲得的最優(yōu)結合構象及陽性化合物的結合模式。
虛擬篩選：
根據用戶提供的小分子化合物結構數據和目標靶標信息，可遴選D3CARP平臺中分子對接方法、配體相似性搜索方法或深度學習模型方法，開展虛擬篩選，報告虛擬篩選結果并提供分子對接預測的復合物結構信息及陽性化合物的結合模式。靶標預測與虛擬篩選將采用中國科學院上海藥物研究所整合了基于物理和數據驅動的計算方法，構建的綜合性靶標預測與虛擬篩選平臺D3CARP。平臺可以用于預測化合物的潛在作用靶標，以及針對給定靶標虛擬篩選活性化合物，相關成果發(fā)表在Computers in Biology and Medicine雜志上。
