本院歷史可追溯到1933年，前身為中國最早的水利科學研究機構—中國第一水工試驗所，幾經(jīng)變遷，于1958年經(jīng)國務院規(guī)劃委員會批準，將國內(nèi)多家水利水電科研單位合并，組建了水利水電科學研究院，1994年經(jīng)國家科委批準更名為中國水利水電科學研究院，2000年水利部牧區(qū)水利科學研究院和水利部電力工業(yè)部機電研究所并入我院�，F(xiàn)任院長匡尚富，歷任院長有張子林、張光斗、林秉南、張澤禎、楊德曄、陳炳新、梁瑞駒、高季章。先后擁有中國科學院和中國工程院院士13人，現(xiàn)有院士6人分別是中國科學院院士陳祖煜，中國工程院院士朱伯芳、陳厚群、王浩、繆昌文、胡春宏；已故院士7人分別是中國科學院和中國工程院兩院院士張光斗、林秉南，中國科學院院士黃文熙、錢寧、汪聞韶，中國工程院院士陳志愷、韓其為。

歷經(jīng)幾十年的發(fā)展，本院已建設成為人才優(yōu)勢明顯、學科門類齊全的國家級綜合性水利水電科學研究和技術開發(fā)中心。截止2020年底，全院在職職工1328人，其中包括碩士以上學歷942人（博士561人）、副高級以上職稱894人，是科技部“創(chuàng)新人才培養(yǎng)示范基地”�，F(xiàn)有13個非營利研究所、4個科技企業(yè)、1個綜合事業(yè)和1個后勤企業(yè)，擁有4個國家級研究中心、9個部級研究中心，1個國家重點實驗室、2個部級重點實驗室。研究領域已覆蓋水文水資源、水環(huán)境與生態(tài)、防洪抗旱與減災、泥沙與水土保持、農(nóng)村水利、水力學、巖土工程、水工結構與材料、工程抗震、水力機械與機電、自動化、工程監(jiān)測與檢測、新能源、遙感技術及應用、水利史與水文化、牧區(qū)水利等18個學科、93個專業(yè)方向。具有工程咨詢單位甲級資信證書（水利水電、電力（含火電、水電、核電、新能源）、生態(tài)建設和環(huán)境工程）、水文水資源調(diào)查評價甲級資質(zhì)證書、水資源論證甲級資質(zhì)證書、生產(chǎn)建設項目水土保持監(jiān)測單位水平評價證書（5星）、生產(chǎn)建設項目水土保持方案編制單位水平評價證書（5星）、水利工程質(zhì)量檢測單位甲級資質(zhì)證書（巖土類、混凝土工程類、量測類、機械電氣類）、水利工程建設市場主體信用評價AAA等級（質(zhì)量檢測類、咨詢類、供貨類）、文物保護工程勘察設計甲級資質(zhì)等證書，通過了國家計量認證、ISO9001質(zhì)量管理體系認證等，被遴選為國家發(fā)改委、北京市政府固定資產(chǎn)投資項目咨詢評估機構以及水利部水利水電建設工程蓄水安全鑒定、大中型水閘安全評價和水土保持設施驗收技術評估單位。

本院擁有4個國家級中心分別為國家節(jié)水灌溉北京工程技術研究中心、國家農(nóng)業(yè)灌排設備質(zhì)量監(jiān)督檢驗中心、國家水電可持續(xù)發(fā)展研究中心和國家能源水能高效利用與大壩安全技術研發(fā)中心；9個部級中心分別為水利部防洪抗旱減災工程技術中心、水利部水資源與水生態(tài)工程技術研究中心、水利部水土保持生態(tài)工程技術研究中心、水利部水環(huán)境監(jiān)測評價研究中心、水利部遙感技術應用中心、水利部草地水土保持生態(tài)研究中心、水利部水工程抗震與應急支持工程技術研究中心、水利遺產(chǎn)保護與研究國家文物局重點科研基地、水利部江河水利志收藏館。建有1個國家級重點實驗室為流域水循環(huán)模擬與調(diào)控國家重點實驗室，2個部級重點實驗室分別為水利部水工程建設與安全重點實驗室和水沙科學與江河治理重點實驗室，另有36個專業(yè)實驗室，配備大型高速水流減壓箱、大型三向六自由度模擬地震振動臺、離心模擬試驗機、水力機械模型通用試驗臺、水質(zhì)色譜-質(zhì)譜聯(lián)機儀等許多在規(guī)模和性能方面均位于國內(nèi)外前列的重要儀器設備，以及一大批自主開發(fā)的水利水電計算機軟件和大型高性能的并行計算平臺，為科學研究創(chuàng)造了優(yōu)良的科研條件。

多年來，本院主持承擔了一大批國家級重大科技攻關項目和省部級重點科研項目，承擔了國內(nèi)幾乎所有重大水利水電工程關鍵技術問題的研究任務，還在國內(nèi)外開展了一系列的工程技術咨詢、評估和技術服務等科研工作。全院科研事業(yè)穩(wěn)步發(fā)展，研究取得了一大批原創(chuàng)性、突破性科研成果。截止2020年底，全院共獲得省部級以上科技進步獎勵886項，其中國家級獎勵104項；主編或參編國家和行業(yè)標準458項。

本院在國際水利水電舞臺也占有十分重要的地位，是聯(lián)合國教科文組織和中國政府合屬的國際泥沙研究培訓中心的掛靠單位，也是世界泥沙研究學會、世界水土保持學會、國際水利與環(huán)境工程學會、國際洪水管理大會、國際大壩委員會、國際灌排委員會、全球水伙伴、國際水電協(xié)會、亞洲河流生態(tài)修復網(wǎng)絡9個大型國際學術組織或會議機制總部及中國委員會秘書處的掛靠單位，先后有10余位專家在國際組織內(nèi)擔任榮譽主席、副主席、秘書長等重要職務，與國外近40余家科研機構、知名大學、國際組織和企業(yè)簽訂了長期合作協(xié)議，建立了固定的合作交流機制。

從20世紀50年代起，本院就開始研究生的培養(yǎng)，是國務院學位辦首批授予的“水利工程”一級學科培養(yǎng)單位，中組部指定的水利系統(tǒng)唯一承擔“西部之光”訪問學者的培養(yǎng)單位，設有2個一級學科博士后流動站和8個博士和碩士學位授予專業(yè)，分別為巖土工程、水文學及水資源、水力學及河流動力學、水工結構工程、水利水電工程、水環(huán)境學、水信息學、水災害與水安全。2018年獲得國際學生招收資質(zhì)。截止2020年底，本院共有研究生導師261人，其中博士生導師89人、碩士生導師172人。1978年恢復招生以來，累計招收培養(yǎng)了博士、碩士研究生以及博士后2056人，“西部之光”訪問學者90人。

本院提出了“到2020年進入世界一流科研院的行列，到2035年進入世界一流科研院的前列，到2050年成為引領世界水利水電科技的排頭兵”的總體發(fā)展目標。我們將面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟主戰(zhàn)場、面向國家需求，堅持“123456”總體發(fā)展思路，銳意進取、攻堅克難、勇攀高峰，奮力加快水利水電科技創(chuàng)新，切實加強科技供給與服務，為推動水利水電跨越發(fā)展提供有力支撐，為建設世界水利水電科技強國貢獻應有力量。