馮教授及其合作者在風(fēng)暴潮動力學(xué)研究中創(chuàng)建了超淺海風(fēng)暴潮模型，并將風(fēng)暴潮動力學(xué)和預(yù)報模型及方法系統(tǒng)化，相關(guān)成果“淺海風(fēng)暴潮動力機制和預(yù)報方法的研究”獲國家自然科學(xué)獎三等獎(1982)。其專著《風(fēng)暴潮導(dǎo)論》(1982)是世界上第一部系統(tǒng)論述風(fēng)暴潮機制和預(yù)報的專著，獲全國優(yōu)秀科技圖書一等獎。他主持的國家“七五”、“八五”重點科技攻關(guān)專題獲得了高度評價，部分工作已達到國際領(lǐng)先水平。其中主持的“七五”攻關(guān)專題作為一部分，獲得“國家七五科技攻關(guān)重大成果獎”(1991)，他的工作促進了風(fēng)暴潮學(xué)科的發(fā)展和預(yù)報的進步。

　　馮教授在淺海環(huán)流和長期物質(zhì)輸運方面的研究成果尤為突出。在這一當(dāng)前近海環(huán)境海洋學(xué)研究焦點中，他及其合作者給出的拉格朗日余環(huán)流和長期輸運方程獨具特色，物理意義異常明確，且對長期物質(zhì)輸運的計算提供了非常節(jié)省的計算模型，受到國內(nèi)外同行的重視。如已被應(yīng)用于美國Chesapeake灣的時均鹽度場以及富營養(yǎng)化問題和渤海營養(yǎng)鹽、初級生產(chǎn)問題等的模擬和預(yù)測；建立的斜壓淺海環(huán)流方程組應(yīng)用于渤海、黃海、東海環(huán)流和泥沙輸運的數(shù)值模擬和機制研究。相關(guān)成果“拉格朗日余流和長期輸運過程的研究——一種三維空間弱非線性理論”獲國家自然科學(xué)獎三等獎（1989)。他的工作促進了淺海動力學(xué)、環(huán)境海洋學(xué)和海洋生態(tài)動力學(xué)的進步。

      馮教授及其合作者主編的面向21世紀課程國家級重點教材《海洋科學(xué)導(dǎo)論》（1999），獲全國普通高等學(xué)校優(yōu)秀教材一等獎（2002）；教學(xué)成果“面向二十一世紀海洋科學(xué)專業(yè)的教學(xué)改革與實踐”及“海洋科學(xué)類專業(yè)人才培養(yǎng)模式的改革與實踐”，分別于2000年和2005年獲《全國教學(xué)優(yōu)秀成果》二等獎。

馮教授現(xiàn)任全國政協(xié)委員，民主建國會中央常委。國務(wù)院學(xué)位委員會海洋科學(xué)評議組組長；全國博士后管委會學(xué)科專家組成員；中國博士后科學(xué)基金會學(xué)科專家組成員；教育部高等學(xué)校海洋科學(xué)與工程類專業(yè)教學(xué)指導(dǎo)委員會主任等。