二期工程選址位于城東魏家嘴，工程規(guī)模為12萬m3/d，位于一期工程的東側，緊鄰一期工程布置。二期工程采用改良型的A2/O脫氮除磷二級處理工藝。主要建設內容包括廠區(qū)的細格柵間、曝氣沉砂池、A2/O生物池、二沉池、污泥處理系統(tǒng)改造、除臭系統(tǒng)以及污水配套管網(wǎng)等。污水處理后達到《城鎮(zhèn)污水處理廠污染物排放標準》GB18918-2002一級B標準后排入長江。污泥廠區(qū)處理后外運進行無害化處理。批復概算總投資為24682萬元。

目前安慶市城東污水處理廠一期的處理規(guī)模已不能完全處理實際產生的污水，二期工程的建設對改善污水處理環(huán)境，完善城市基礎設施建設都是十分必要的。